تعد مصر من الدول المؤسسة لمنظمة التعاون الإسلامي حيث شاركت في القمة الإسلامية الأولى التي عقدت بمدينة الرباط في 25 سبتمبر 1969، والتي أسفرت عن قرار إنشاء المنظمة (منظمة المؤتمر الإسلامي آنذاك) رداً على جريمة إحراق المسجد الأقصى فى القدس المحتلة، ثم شاركت في عام 1970 في أول مؤتمر إسلامى للسادة وزراء الخارجية عُقد بمدينة جدة، حيث تقرر إنشاء أمانة عامة للمنظمة يكون مقرها جدة ويرأسها أمين عام للمنظمة. 

تولى الفريق حسن التهامى، نائب رئيس وزراء مصر الأسبق، منصب أمين عام المنظمة خلال الفترة من1974 إلى 1975.

تشارك مصر بفاعلية منذ نشأة المنظمة في القمم الإسلامية انطلاقاً من سعيها الدائم لإيجاد حلول للقضايا والمشكلات التي تواجه الأمة الإسلامية، كما أنها تحرص على المساهمة والتواجد الفعال في كافة الأطر الأخرى المنبثقة عن المنظمة وعلى رأسها مجلس وزراء الخارجية، والدورات الوزارية القطاعية المختلفة، واللجان الدائمة المنبثقة عن المنظمة، فضلاً عن الأجهزة الفرعية والمؤسسات التابعة للمنظمة.

تستضيف مدينة القاهرة مقر منظمة تنمية المرأة، إحدى المؤسسات المتخصصة لمنظمة التعاون الإسلامي تأسست عام 2005، وكان لمصر جهداً رائداً في تأسيسها كأول منظمة دولية متخصصة في إطار منظومة التعاون الإسلامي لتعزيز وحماية حقوق المرأة والنهوض بأحوالها في كافة الدول الأعضاء بالمنظمة الإسلامية. تجدر الإشارة إلى أن النظام الأساسي لمنظمة تنمية المرأة تم اعتماده في عام 2010 ودخل حيز التنفيذ في عام 2020.