في إطار التعاون بين مصر وبوروندي في مجال الصحة، نشرت صحيفة"Le  Renouveauالبوروندية مقالا بتاريخ 31/3/2008، أبرزت فيه قيام الحكومة المصرية – عن طريق سفارة مصر في بوجمبورا – بتسليم الحكومة البوروندية المعونة الدوائية التي دأبت مصر على منحها للحكومة البوروندية منذ عام 2005.

تجدر الإشارة إلي أن الجانبين – مصر وبوروندي- وقعا اتفاقية لإنشاء المركز الطبي المصري البوروندي المشترك خلال أعمال الدورة الخامسة للجنة المصرية البوروندية المشتركة التي عقدت في القاهرة في أبريل 2006، كما تم إيفاد 18 طبيبا مصريا من تخصصات طبية مختلفة للعمل في عدد من المستشفيات الحكومية البوروندية.